وی در بخش دیگری از این مصاحبه می‌گوید: جالب است که آقایان منتظر توضیحات توفیقی نیستند و اصرار دارند که او خطاکاری است که گناهش بخشیده نخواهد شد. آن‌ها در شرایطی در حال پرونده سازی هستند که اگر قرار بود ما از اشتباهات و خطاهای اصولگرایان سند سازی کنیم، هزاران پرونده داشتیم؛ اما این کار در مرام اصلاح طلبی نیست.[1]

محمدرضا عارف از دیگر اصلاح‌طلبانی است که اصرار دارد، رقبای اصلاح‌طلبان علیه این جریان پرونده‌سازی می‌کنند. وی با تاکید براینکه شخصاً حاضرم برای حفظ انسجام و یکپارچگی جریان اصلاح‌طلب هزینه بدهم، در واکنش به گلایه فعالان دانشجویی از حاکمیت فضای امنیتی در دانشگاه‌ها، می‌گوید: متاسفانه دامنه برخوردهای امنیتی به خارج از دانشگاه رسیده است و با تهدید و پرونده سازی می‌خواهند جریان اصلاحات را منفعل کنند.[2]

احمد مسجدجامعی نیز از جمله افرادی است که معتقد است علیه وی پرونده‌سازی می‌کنند. وی می‌نویسد: وقتی که با اصرار در مقام عضو شورای شهر همراه با دیگر دوستان، خواهان رسیدگی به پرونده املاک نجومی و انحرافات تفریغ بودجه و فاجعهٔ پلاسکو و مانند آن‌ها شدیم، می‌دانستم که دیر یا زود تهمت‌ها من را نشانه خواهند گرفت.[3]

این ادعاها در حالی صورت می‌گیرد که فائزه هاشمی در مصاحبه با حسین دهباشی مدعی می‌شود که برخی از وزرای دولت روحانی برای زیردستان خود پرونده‌سازی می‌کنند و از این طریق آنها را برکنار می‌کند. فائزه هاشمی در این مصاحبه می‌گوید:

مثلاً ما الآن وزیر داریم که پرونده می‌سازند برای مدیرانش قبل از اینکه اون‌ها رو منصوب بکنند! توی سیستمش خبرچین گذاشته، توی تمام تشکیلاتش اصلاً نگم بعضی چیزها رو.

شما دارید مثال ذهنی می‌زنید؟

نه واقعیت هست! من دارم واقعیت رو می‌گم. چون من این‌ها رو اطلاعات دارم که دارم می‌گم بعد مدیر رو که می‌خواد منصوب بکنه اول می‌ره براش یک پرونده درست می‌کنه حالا واقعی یا غیر واقعی! چرا؟ چون خودش از این کمیته‌های پاکسازی دراومده! در ابتدای انقلاب توی کمیته‌های پاکسازی بوده که استادها رو اخراج می‌کرده توی اون شورای عالی انقلاب فرهنگی ...

شما درباره آقای احمدی‌نژاد دارید صحبت می‌کنید؟

نخیر! من در مورد وزیر آقای روحانی دارم صحبت می‌کنم. خودش توی اون کمیته پاکسازی بوده که استادها رو اخراج می‌کرده، اون نگاه امنیتی هنوز همراهش هست. استاد دانشگاه شده مثل همه وزرای ما، بعد توی تمام تشکیلات زیرمجموعه‌اش خبرچین گذاشته، اون‌ها خبر براش می‌یارن که داره توی فلان تشکیلات، فلان مدیریت، فلان اداره چه اتفاقی می‌افته! وقتی مدیرش اون حرف غیرکارشناسی‌اش رو عمل نمی‌کنه با پرونده‌ای که از ابتدا برایش ساخته مجبورش می‌کنه به استعفا، یا اخراجش می‌کنه اگر بتونه! یعنی نگاه این‌ست؛ یعنی من توی یک وزارتخانه رو می‌دونم که دارم بهتون می‌گم! نگاه، نگاه امنیتی‌ست، نگاه، نگاه واقعی و تخصصی نیست.[4]