بولتون که در سیاست خارجی دیدگاه های نئو محافظه کارانه دارد، هم اکنون در اندیشکده آمریکن اینترپرایز فعالیت می کند. بولتون منتقد جدی سیاست خارجی باراک اوباما رئیس جمهور آمریکا به شمار می رود و از رویکرد کاخ سفید در قبال توافق هسته ای با ایران، جنگ علیه داعش به شدت انتقاد کرده و از حامیان سرسخت اسرائیل به شمار می رود.

بولتون همچنین از سیاست های اوباما در قبال روسیه نیز انتقاد کرده و بر این باور است که آمریکا باید با روسیه مانند یک دشمن، رفتار کند. وی از حامیان اعمال تحریم های اقتصادی بیشتر علیه روسیه است و از ارسال کمک های نظامی کشنده برای دولت اوکراین نیز حمایت می کند.