کتابخانه آیت الله مرعشی نجفی یکی از گنجینه های نسخ خطی با ارزش و منحصر به فرد است این کتابخانه 30هزار جلد نسخه خطی دربرگیرنده 60 هزار عنوان رساله را در خود جای داده است .