آیت الله شریعتمداری از جمله افرادی است که پس از پیروزی انقلاب اسلامی، به مرور زمان مقابل این انقلاب و رهبر آن، امام خمینی ایستاد و تا جایی پیش رفت که می‌خواست آذربایجان را از ایران جدا نماید.