به گزارش مشرق، این مسجد دارای تزئینات و ویژگیهای متعدد معماری در شبستانها، گنبدها، محراب، ایوان، گلدسته، کتیبهها و کاشیکاریها است. چهار وقفنامه برای مسجد، بین سالهای ۱۲۶۲ق تا ۱۲۷۳ق نگاشته شده و همه مکانهای مسجد برای موارد خاص وقف شده است. مقبره سید شفتی و فرزندان او در این مسجد قرار دارد.
مسجد سید اصفهان از مساجد بزرگ و از بناهای تاریخی دوره قاجار در شهر اصفهان. این مسجد که به نام بنیانگذار آن سید محمدباقر شفتی شهرت دارد، در سال ۱۲۴۰ق در محله بیدآباد اصفهان بنا نهاده شد.