به همين مناسبت روش هاي خواندن اين نماز يادآوري مي شود. طبق فتاواي مراجع، نماز آيات را مي توان به دو روش خواند. يك شيوه آن است كه قبل از هر ركوع، يك حمد و سوره بخواند و شيوه ديگر آن است كه بعد از خواندن حمد، يك سوره را به پنج قسمت تقسيم كرد و بعد از خواندن هر قسمت به ركوع رفت.
براي خواندن نماز آيات به شيوه دوم به نظرات برخي مراجع توجه مي كنيم.
حضرت آيت الله خامنه اي در 'اجوبه الاستفتائات' مي فرمايد: بعد از نيت و تكبيرةالاحرام، حمد و يك آيه (البته احتساب بسم‌الله به عنوان يك آيه خلاف احتياط است) از سوره‏اي را قرائت و ركوع كند، سپس سر از ركوع بردارد و آيه ديگري از آن سوره را بخواند و به ركوع رود و بعد سر از ركوع برداشته و آيه ديگري از همان سوره را قرائت نمايد و همين طور تا ركوع پنجم ادامه دهد تا سوره‏اي كه پيش از هر ركوع، يك آيه از آن را قرائت كرده، قبل از ركوع آخر تمام شود.
آيت الله العظمي سيستاني نيز مي فرمايد: در نماز آيات ممكن است انسان بعد از نيت و تكبير و خواندن حمد، آيه‏هاي يك سوره را پنج قسمت كند و يك آيه يا بيشتر از آن را بخواند. بلكه كمتر از يك آيه را نيز مي‏تواند بخواند ولي بايد (بنابر احتياط) جمله تامه باشد و از اول سوره شروع كند و به گفتن 'بسم الله‏' اكتفا نكند و سپس به ركوع رود و سر بردارد و بدون اينكه حمد بخواند، قسمت دوم از همان سوره را بخواند و به ركوع رود و همين طور تا پيش از ركوع پنجم سوره را تمام نمايد.
اين مرجع تقليد در ادامه مي فرمايد: مثلا در سوره فلق، اول 'بسم الله الرحمن الرحيم قل اعوذ برب الفلق' بگويد و به ركوع رود، بعد بايستد و بگويد 'من شر ما خلق'، دوباره به ركوع رود و بعد از ركوع بايستد و بگويد 'ومن شر غاسق اذا وقب' باز به ركوع رود و بايستد و بگويد 'و من شر النفاثات في العقد' و به ركوع رود و دوباره سر بردارد و بگويد 'ومن شر حاسد اذا حسد' و بعد از آن به ركوع پنجم رود.(مساله 1488)
در نماز آيات نيز طبق مساله 1515 رساله حضرت امام (ره) هر يك از ركوع‏هاي نماز آيات ركن است كه اگر عمدي يا اشتباهي كم يا زياد شود، نماز باطل است.
همچنين از آنجا كه ركوع جزو اركان نماز است، چنانچه انسان به اشتباه يا از روي عمد آن را به جا نياورد يا دوبار به جا آورد، نمازش باطل مي شود.