او در 5 بازی اخیر بایرن مونیخ در ترکیب اصلی به میدان نرفته و تنها 66 دقیقه بازی کرده است. مولر در دیدار اخیر بایرن برابر هوفنهایم که با شکست دو بر یک بایرن همراه شد در نیمه دوم به میدان رفت و توانست یک پاس گل هم بدهد.

او بعد از بازی درحالی که ناراحت به نظر می‌رسید در واکنش به این سوال که آیا به دنبال جدایی است، گفت: چیزی ندارم که بگویم.

روزنامه بیلد آلمان نوشت که شرایط مولر در بایرن به گونه‌ای است که او علیرغم میل باطنی‌اش به دنبال جدایی است و شاید در زمستان باواریای‌ها را ترک کند.

بایرن مونیخ در فصل جاری رقابت‌های بوندسلیگا عملکرد خوبی از خود نشان نداده و از 7 بازی تنها 14 امتیاز کسب کرده و در رده سوم جدول رده بندی جای دارد.