به گزارش گروه دفاع و امنيت مشرق، خبرگزاري فرانسه گزارش داد فرماندهان اصلي القاعده که از زمان حملات يازدهم سپتامبر سال 2001آمريکا کشته يا دستگير شده اند به شرح زير است:
28 مارس سال 2002: ابوزبيده عضو فلسطيني شبکه القاعده که دست راست اسامه بن لادن سرکرده اين شبکه خوانده شده بود در پاکستان بازداشت شد.
اواخر اکتبر: عبدالرحيم النشيري مدير عمليات مهم شبکه القاعده در خليج فارس در امارات عربي متحده بازداشت شد. وي تبعه عربستان بود.
اول مارس سال 2003: خالد شيخ محمد فرد شماره سه القاعده که گمان مي رود مغز متفکر حملات يازدهم سپتامبر سال 2001 امريکا باشد در پاکستان بازداشت شد.
چهاردهم اوت: رضوان عصام الدين معروف به حنبلي و نماينده القاعده در جنوب شرق آسيا و مظنون طراحي بمب گذاري هاي بالي در سال 2002 در تايلند بازداشت شد. وي تبعه اندونزي بود.
18 ژوئن سال 2004 : عبدالعزيز المقرن فرمانده عربستاني الاصل القاعده در عربستان سعودي در رياض کشته شد. خالد علي حاج فرمانده پيشين القاعده در عربستان سعودي سه ماه پيشتر کشته شده بود.
دوم ماه مه سال 2005: ابو فرج الليبي فرد شماره سه القاعده و رئيس شبکه القاعده در پاکستان در شمال غربي اين کشور بازداشت شد.
11اوت: ابو قتاده يک اردني پاکستاني الاصل که به عنوان " سفير " القاعده در اروپا حضور داشت براي دومين بار در انگليس بازداشت شد.
27 اوت سال 2006: فهد الجوير رئيس شبکه القاعده در عربستان سعودي در نزديکي رياض کشته شد. صالح العوفي رئيس پيشين شبکه القاعده در عربستان سعودي در اوت سال 2005 کشته شده بود.
هفتم ژوئن: ابومصعب الزرقاوي رئيس اردني شبکه القاعده در عراق در حمله هوايي در عمليات نيروهاي آمريکا و عراق در شمال بغداد کشته شد.
25سپتامبر: عمر الفاروق يکي از افراد نزديک به بن لادن و رئيس شبکه القاعده در جنوب شرق آسيا به دست نيروهاي انگليس در بصره در جنوب عراق کشته شد. وي تبعه کويت بود.
29 ژانويه سال 2008: ابوليث الليبي يکي از فرماندهان القاعده در افغانستان و يکي از افراد نزديک به بن لادن در حمله موشکي آمريکا به شمال غربي پاکستان کشته شد.
18 آوريل سال 2010: ابو عمر البغدادي فرمانده مظنون القاعده در عراق و ابو ايوب المصري رئيس نظامي وي در عمليات نظامي مشترک آمريکا و عراق در شمال بغداد کشته شد.
اول ژوئن: القاعده اعلام کرد مصطفي ابو اليزيد يکي از فرماندهان رده سوم القاعده و رئيس عملياتي اين شبکه در افغانستان کشته شد.
اول ماه مه سال 2011: باراک اوباما رئيس جمهور آمريکا اعلام کرد نيروهاي آمريکايي بن لادن را در عملياتي کماندويي در آبوت آباد شهري در شمال اسلام آباد کشتند و جسدش را پيدا کردند.
