به گزارش مشرق، حجت‌الاسلام و المسلمين سقاي بي‌ريا در گفتگو با ايسنا در مورد اخبار منتشر شده مبني بر استعفاي وي گفت: استعفايم را به رييس‌جمهور تقديم کرده بودم که اين استعفا مورد قبول رييس‌جمهور قرار نگرفت و با توجه به اين موضوع به کار خود ادامه خواهم داد.
بنابراين گزارش روز گذشته " مشرق" نوشت: محمدناصر سقاي بي‌ريا مشاور رئيس جمهور در امور روحانيت اخيرا استعفاي خود را تقديم احمدي نژاد کرده است.
در حالي که بيش از يک هفته از تقديم اين استعفا به احمدي‌نژاد مي‌گذرد اما هنوز پاسخي از سوي رئيس جمهور در رد يا قبول استعفاي مشاور امور روحانيت رياست جمهوري ابراز نشده است.
برخي منابع علت استعفاي سقاي بي‌ريا را اختلاف نظر ميان وي و رئيس جمهور درباره طرح عفاف و حجاب دانسته‌اند.
سقاي بي‌ريا از شاگردان نزديک آيت الله مصباح يزدي است و استعفاي وي پس از ديدار با وي تقديم دکتر احمدي‌نژاد شده است.